東北季風吹起就是旗魚的季節，不過，國內最主要的旗魚漁獲港－台東縣成功鎮新港漁港，今年漁獲量卻比去年同期減了一半；漁民表示，「黑潮不見了」，找不到漁場。由於國內對黑潮的研究缺乏，專家初步研判，導致黑潮「亂流」的部份原因，可能是受到東北季風的影響。

利用標竿鏢旗魚的漁民張再興說，黑潮和沿岸流、以及親潮的交會處是旗魚聚集的漁場，但是今年船出港竟然找不到黑潮，黑潮遠退至綠島。十月整整一個月看不到黑潮，他捕魚三十年還是第一次碰到「黑潮不見」。張再興說，黑潮正常流向是往北，到了台灣東北角才轉東北，但是今年黑潮在成功外海就偏向東北，黑潮流向改變且遠離。

農委會水產試驗所東部海洋生物研究中心博士江偉全表示，國內對黑潮的研究尚在累積經驗，為何主流會遠離岸邊，不是很清楚；不過這幾天東北季風增強，黑潮又接近岸邊，只能說，東北季風應該會影響黑潮。